五个月宝宝夜里睡觉摇头扭动身体，可能是生理因素、皮肤问题、维生素D缺乏或其他原因引起，如睡眠环境不适、湿疹、中耳炎、肠道寄生虫等。如果持续时间较长或伴有其他异常症状，建议及时就医，明确原因并治疗。家长应注意保持宝宝睡眠环境舒适，及时清理皮肤。
五个月宝宝夜里睡觉总是摇头扭动身体，可能由以下原因引起：
1.生理因素
睡眠环境：宝宝睡觉时所处的环境温度过高、过低，或被褥过厚、过硬，都可能导致宝宝感觉不舒服，从而出现摇头、扭动身体的现象。
生长发育：宝宝在生长发育过程中，神经系统不断发育完善，可能会出现一些不自主的运动，如摇头、扭动身体等，这是正常的生理现象。
2.皮肤问题
湿疹：宝宝皮肤娇嫩，如果患有湿疹，会出现瘙痒、疼痛等症状，从而导致宝宝在睡觉时摇头、扭动身体。
痱子：如果宝宝出汗较多，没有及时清理，可能会导致痱子的出现，使宝宝感到瘙痒，从而出现摇头、扭动身体的现象。
3.维生素D缺乏
维生素D缺乏性佝偻病是婴幼儿常见的营养缺乏症，主要表现为神经兴奋性增高，如易激惹、烦躁、睡眠不安、夜间啼哭、多汗（与季节无关）等，宝宝会出现摇头、摩擦枕头、后脑勺脱发等症状。
4.其他
中耳炎：如果宝宝患有中耳炎，会出现耳部疼痛、瘙痒等症状，从而导致宝宝在睡觉时摇头、扭动身体。
肠道寄生虫：如果宝宝肠道内有寄生虫，如蛔虫等，会分泌毒素，刺激宝宝的神经，导致宝宝出现摇头、扭动身体等症状。
如果宝宝夜里睡觉总是摇头扭动身体，持续时间较长或伴有其他异常症状，建议及时就医，进行相关检查，以明确原因，并在医生的指导下进行治疗。同时，家长应注意保持宝宝的睡眠环境舒适、安静，及时清理宝宝的皮肤，保持皮肤清洁、干燥。如果宝宝有缺钙的表现，应及时补充维生素D和钙剂。