乳腺结节有时疼痛的原因可能是乳腺增生、乳腺炎、乳腺肿瘤或肋软骨炎、胸膜炎、颈椎病、心理因素等，也可能是其他疾病的表现，需及时就医，明确诊断并治疗。
乳腺结节有时疼痛的原因可能有以下几点：
一、乳腺增生
1.内分泌紊乱
（1）雌激素水平过高（2）孕激素水平不足（3）催乳素水平升高等。
2.乳腺组织对激素变化敏感
（1）青春期、妊娠期、哺乳期（2）口服避孕药或镇静药等。
二、乳腺炎
1.感染
（1）细菌感染（2）病毒感染（3）真菌感染等。
2.非感染因素
（1）乳头内陷（2）乳头损伤（3）乳房外伤等。
三、乳腺肿瘤
1.良性肿瘤
（1）乳腺纤维腺瘤（2）乳腺导管内乳头状瘤（3）乳腺脂肪瘤等。
2.恶性肿瘤
（1）乳腺癌（2）乳腺肉瘤等。
四、其他原因
1.肋软骨炎
2.胸膜炎
3.颈椎病
4.心理因素等。
需要注意的是，乳腺结节有时疼痛也可能是其他疾病的表现，因此，如果出现这种情况，应及时就医，进行相关检查，以明确诊断，并采取相应的治疗措施。