补牙后一直隐隐自发疼可能有以下原因：
1.补牙材料刺激：补牙材料可能会对牙髓组织产生轻微刺激，导致疼痛。这种疼痛通常会在一段时间后自行缓解。
2.龋齿未完全去除：如果龋齿没有被完全去除，牙髓组织可能仍然受到感染或炎症的刺激，导致疼痛。
3.牙髓感染：补牙后，牙髓可能受到感染，引发牙髓炎，导致疼痛。这种疼痛通常比较剧烈，可能伴有牙龈肿胀和发热等症状。
4.牙齿受力：补牙后，如果牙齿承受过大的压力或咬合力，可能会导致疼痛。
5.其他口腔问题：除了补牙的牙齿本身，其他口腔问题也可能导致疼痛，如牙龈炎、牙周炎等。
如果补牙后疼痛持续时间较长、疼痛程度加重或伴有其他异常症状，建议及时就医。医生会进行详细的口腔检查和诊断，确定疼痛的原因，并根据具体情况采取相应的治疗措施，如调整补牙材料、进行根管治疗等。同时，在补牙后的恢复期间，应注意口腔卫生，避免食用过硬或过热的食物，以减少对牙齿的刺激。