补牙后一直隐隐自发疼可能是由以下原因引起：
1.补牙时未垫底或垫底材料选择不当：如果在深龋洞垫底时，垫底材料选择不当，如氧化锌丁香油粘固粉，就可能刺激牙髓，导致补牙后出现自发痛。
2.深龋：龋洞较深，用氧化锌丁香油粘固粉暂封后，会出现冷热刺激痛，这是由于垫底不完善导致的。
3.牙髓受激惹：补牙过程中，制备洞形时的机械刺激，以及制备过程中切割牙体组织过多，接近牙髓，可能导致牙髓处于激惹状态，引起补牙后近期出现疼痛，但疼痛多能自行恢复。
4.已有牙髓炎或根尖周炎：患牙本身可能就存在牙髓炎或根尖周炎，只是未进行完善的根管治疗，补牙后由于充填物的压迫，出现牙髓炎或根尖周炎的症状，引起疼痛。
5.其他：如果补牙后不注意口腔卫生，食物残渣嵌入龋洞，导致继发龋，也会引起疼痛。此外，补牙后咬合过高，也可能导致咬合痛。
如果补牙后出现一直隐隐自发疼的情况，建议及时就医，医生会根据具体情况进行检查和诊断，并给出相应的治疗建议。在等待就医期间，应注意保持口腔卫生，避免用患侧咀嚼食物，避免食用辛辣、刺激性食物，同时应避免用手或其他工具刺激患牙。