免费疫苗和自费疫苗的不同主要体现在以下几个方面：
1.费用：免费疫苗是国家免费提供的，而自费疫苗需要自费接种。
2.预防的疾病：免费疫苗主要预防一些常见的、危害较大的疾病，如乙肝、卡介苗、麻疹等；自费疫苗则可以预防一些更为特殊或高风险的疾病，如流感嗜血杆菌疫苗、肺炎球菌疫苗等。
3.效果和安全性：免费疫苗和自费疫苗在效果和安全性上都经过了严格的临床试验和监管，都是安全有效的。
选择接种哪种疫苗需要考虑以下因素：
1.个人健康状况：如果个体有某些健康问题或过敏史，需要根据具体情况咨询医生，选择适合的疫苗。
2.疾病流行情况：根据当地的疾病流行情况，医生会建议接种相应的疫苗。
3.经济状况：自费疫苗需要自费接种，需要考虑个人的经济承受能力。
总的来说，免费疫苗和自费疫苗都是为了保护公众的健康，选择哪种疫苗应该根据个人情况和医生的建议来决定。无论选择哪种疫苗，都应该按照规定的程序进行接种，以获得最佳的保护效果。