手腕腱鞘囊肿的治疗方法包括对较小及浅表的囊肿可不作处理或通过挤压使其破裂自行吸收，与关节腔相通的不易破裂的囊肿可穿刺抽液后加压按揉，或注入皮质激素或透明质酸酶并加压包扎，保守治疗无效时可选择手术切除腱鞘囊肿及囊壁以防止复发。
手腕腱鞘囊肿的最佳治疗方法如下：
1.对于较小的手腕腱鞘囊肿，可不作处理，使用护腕保护腕关节。浅表的囊肿，可通过挤压使腱鞘囊肿破裂，让其逐渐自行吸收。
2.与关节腔相通的囊肿不易破裂，可采用穿刺抽出囊液，然后加压按揉。也可将囊液抽出后注入皮质激素或透明质酸酶，局部加压包扎两天，会有一定疗效。囊内注射时，可选用醋酸氢化可的松或泼尼松龙。
3.当保守治疗方法无效时，可选择手术治疗。手术一般切除腱鞘囊肿，将囊壁整个切除，可有效防止腱鞘囊肿复发。手术治疗相较于保守治疗的优点在于能有效防止复发。