肛门周围有小疙瘩并伴有疼痛可能是外痔、肛周脓肿、肛裂、肛管直肠癌、直肠炎或其他肛肠疾病引起，需要及时就医，明确诊断，采取相应的治疗措施。
肛门周围有小疙瘩并伴有疼痛，可能是以下原因引起：
1.外痔：（一）血栓性外痔：（1）常有肛门部剧痛，肿物表面皮肤呈青紫色，排便或咳嗽时可加重，（2）局部有圆形肿物，触痛明显，（3）如果皮下有出血，可在肛门部触及硬而有弹性的肿块。（二）静脉曲张性外痔：（1）肛门缘隆起的成椭圆形或长形的肿物，触之柔软，无疼痛，（2）在肛门的后方或中间，（3）在大便或剧烈活动后，肿物增大，可有坠胀或异物感。
2.肛周脓肿：（一）肛门周围脓肿：（1）逐渐加重的肛门肿痛或跳痛，（2）可伴有全身不适、发热、食欲不振，（3）检查时可发现肛门周围有红肿、硬结或触痛，（4）脓肿形成后，可在肛门周围触及波动感。（二）坐骨直肠窝脓肿：（1）有全身症状，如发热、寒战、乏力等，（2）局部症状为肛门坠胀、疼痛、有便意不尽感，（3）可伴有排尿困难、里急后重。
3.肛裂：（一）典型症状是肛门疼痛、便秘和出血，（二）疼痛多剧烈，有典型的周期性，（三）便时便后肛门部疼痛剧烈，持续数小时后缓解，（四）伴有便血，出血鲜红色。
4.肛管直肠癌：（一）早期症状不明显，（二）后期可出现肛门部坠胀、疼痛、脓血便、里急后重等，（三）指诊或直肠镜检查可发现肿物。
5.直肠炎：（一）腹泻、腹痛，（二）排黏液脓血便，（三）伴有里急后重，（四）肛门坠胀。
6.其他：（一）肛门异物损伤：（1）肛门部有异物嵌入，（2）可有疼痛、出血，（3）检查时可发现肛门部有异物。（二）肛门皮肤病：（1）如肛门湿疹、神经性皮炎等，（2）可出现肛门部瘙痒、疼痛、皮疹等症状。（三）肛管、直肠损伤：（1）可有肛门部疼痛、出血、感染等症状，（2）检查时可发现肛管、直肠有损伤。
如果出现肛门周围有小疙瘩并伴有疼痛，建议及时就医，明确诊断，以便采取相应的治疗措施。