新型冠状病毒感染的肺炎的病毒命名为：严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）。
2020年2月11日，世界卫生组织总干事谭德塞在瑞士日内瓦宣布，将新型冠状病毒感染的肺炎命名为“COVID-19”。2月22日，国家卫生健康委发布通知，“新型冠状病毒肺炎”英文名称修订为“COVID-19”，与世界卫生组织命名保持一致，中文名称保持不变。
此外，国际病毒分类学委员会冠状病毒研究小组（CSG）于2020年1月12日发布的第11版《病毒分类》名录中，将新型冠状病毒正式命名为“SARS-CoV-2”，与引发严重急性呼吸综合征（SARS）的冠状病毒和引发中东呼吸综合征（MERS）的冠状病毒有明显区别，但与它们有一定的亲缘关系。