磁共振检查和CT检查的主要区别如下：
1.成像原理不同：磁共振检查利用磁场和无线电波来生成身体内部的图像；CT检查则通过X线束对身体进行断层扫描，获取二维图像。
2.软组织对比度：磁共振检查对软组织的对比度较好，可以更清晰地显示肌肉、神经、韧带等结构；CT检查对于骨骼结构的显示更为清晰。
3.检查时间：磁共振检查通常需要较长的时间来完成，因为它需要对多个层面进行扫描；CT检查相对较快，可以在较短时间内获取多个层面的图像。
4.对运动的敏感度：磁共振检查对于运动的敏感度较高，对于心脏、肺部等运动器官的检查有一定优势；CT检查对运动的敏感度较低。
5.安全性：磁共振检查不存在辐射，对人体相对安全；CT检查会产生一定量的辐射。
6.适用范围：磁共振检查适用于头部、脊柱、关节、腹部等多个部位的检查，对软组织的病变诊断更有优势；CT检查常用于胸部、腹部、骨骼等部位的检查，对骨折、肺部疾病等的诊断较为常用。
7.禁忌症：磁共振检查禁忌症相对较少，但对装有心脏起搏器、金属植入物等患者需谨慎；CT检查对碘造影剂过敏、孕妇等人群有一定限制。
需要注意的是，在实际应用中，医生会根据具体病情和患者的情况选择合适的检查方法，或结合两种检查方法来获得更全面的诊断信息。患者在进行检查前，应与医生充分沟通，了解检查的优缺点和注意事项，以便做出明智的选择。