牙齿根部牙龈发黑可能是牙结石、龋齿、牙髓坏死、药物因素或其他原因引起，需要就医进行口腔检查和诊断，医生会制定相应的治疗方案，同时保持良好的口腔卫生习惯和定期检查也很重要。
牙齿根部牙龈发黑可能是以下原因引起的：
1.牙结石：(1)牙结石是由食物残渣、细菌和唾液中的矿物质等逐渐沉积在牙齿表面形成的，(2)它通常呈现黄色或棕色，(3)如果不及时清除，牙结石可能会越来越厚，甚至导致牙龈发炎、出血等问题。
2.龋齿：(1)龋齿是由于细菌侵蚀牙齿导致的，(2)初期龋齿可能只是牙齿表面的小黑点，但如果不及时治疗，龋齿会逐渐加深，(3)最终可能导致牙齿疼痛、松动甚至脱落。
3.牙髓坏死：(1)牙髓是牙齿内部的软组织，(2)如果牙髓受到感染或损伤，就会发生坏死，(3)坏死的牙髓会分解产生黑色素，导致牙齿根部牙龈发黑。
4.药物因素：(1)某些药物，如四环素类抗生素，(2)可能会导致牙齿变色，(3)这种变色通常是永久性的，而且不限于牙齿根部。
5.其他原因：(1)牙龈受伤、吸烟、过度摄入咖啡因等也可能导致牙齿根部牙龈发黑，(2)但这些原因相对较少见。
如果发现牙齿根部牙龈发黑，建议及时就医，进行详细的口腔检查和诊断。医生会根据具体情况制定相应的治疗方案，可能包括洗牙、补牙、根管治疗等。此外，保持良好的口腔卫生习惯，定期洗牙，定期检查口腔健康也是预防牙齿问题的重要措施。