女性小腹隐隐作痛可能由多种原因引起，常见的有以下几种：
1.排卵性腹痛：
青春期女孩在排卵时，卵泡破裂，卵泡液对腹膜可能有一定的刺激作用，所以她们有时会出现左右交替的、每月一次的轻微腹痛。
这是一种生理性腹痛，多表现为一侧隐痛、钝痛或坠胀样疼痛，部分少女同时伴有少许阴道出血，即排卵期出血，这是正常现象，一般不需要特殊处理。
2.痛经：
行经前后或月经期出现下腹疼痛、坠胀，伴有腰酸或其他不适，症状严重影响生活质量者，称为痛经。痛经分为原发性痛经和继发性两类，原发性痛经指生殖器官无器质性病变的痛经，占痛经90%以上；继发性痛经指由盆腔器质性疾病引起的痛经。
3.卵巢黄体破裂：
这是因黄体内出血较多所致，伴有突然发作的下腹部或一侧的腹痛，严重时还可出现休克。卵巢黄体破裂绝大部分发生在月经周期的第20～26天，发病时可出现下腹部疼痛，轻重不一。
4.与妊娠有关的疾病：
女性怀孕后，小腹隐痛可能是先兆流产、宫外孕等原因引起。
如是先兆流产，常伴有阴道少量出血，常为暗红色或血性白带，同时还可能出现阵发性下腹痛或腰背痛。
宫外孕指的是受精卵在子宫体腔以外着床，停经后腹痛是宫外孕的主要症状之一，多发生在怀孕40～50天左右，伴有阴道出血现象。
5.急性阑尾炎：
是一种女性常见的腹部疾病，转移性右下腹痛是其典型症状。开始时疼痛多在脐周或上腹部，为阵发性或持续性胀痛，而后逐渐加重，疼痛部位固定在右下腹，呈持续性隐痛。
6.其他：
如子宫内膜异位症、盆腔炎、子宫肌瘤、子宫腺肌病等，也可导致小腹疼痛。
总之，女性小腹隐痛的原因较为复杂，需要及时就医，进行相关检查，如B超、血常规、性激素六项等，以明确病因，并进行针对性治疗。