怀孕时孕酮低主要可能导致先兆性流产和流产，孩子畸形是由夫妻双方染色体异常、男方孕期早期服用致畸药物、病毒感染及 X 放射线等影响所致，和孕酮低无关，预防胎儿畸形可在孕前 3 个月和孕后 3 个月口服叶酸，孕酮低和胎儿畸形无必然联系，但孕酮低可能增加流产风险，孕妇应按时产检，有异常及时就医。
怀孕时孕酮低一般不会导致孩子畸形。以下是具体解释：
1.孕酮在怀孕早期的作用：怀孕初期，孕酮低表示维持妊娠的雌激素不足，主要可能导致先兆性流产和流产。
2.孩子畸形的原因：孩子畸形的发生是由于夫妻双方染色体的异常，以及男方在女方孕期的早期服用了致畸的药物，或者是受到了一些病毒的感染以及X放射线等影响而导致的身体畸形，和孕酮低没有关系。
3.预防胎儿畸形的措施：如果担心胎儿发生畸形，应该在怀孕前3个月和怀孕后3个月，口服叶酸，可有效预防胎儿神经管畸形的发生。
总之，孕酮低和胎儿畸形之间没有必然联系，但孕酮低可能会增加流产的风险。孕妇在孕期应注意按时产检，如有异常情况应及时就医。