肌酸激酶偏高的治疗需视具体情况而定，稍偏高不建议治疗，超过正常值5倍以上且引起心肌炎或心肌梗死才会处理，其中心肌梗死按冠心病方式治疗并开营养心肌药物，心肌炎的治疗为休息加营养心肌，需长期治疗且定期复查，复查频率依患者具体情况而定。
肌酸激酶偏高的治疗需根据具体情况而定。若只是稍微偏高，不建议治疗；超过正常值5倍以上才会予以处理。若肌酸激酶增高未引起心肌炎或心肌梗死，也不会进行处理。但若引起心肌炎和心肌梗死，则需采取相应治疗措施。
对于心肌梗死，按照冠心病的治疗方式处理，并开具一些营养心肌的药物。
对于心肌炎，治疗方法为休息加营养心肌。心肌炎的持续时间较长，需要长期治疗。部分心肌炎患者可根治，部分患者病情会迁延不愈，时好时坏，因此需要定期复查。急性期每月检查1次，缓慢期3个月或6个月1次，检查频率根据患者具体情况而定。