手指上起小水泡的原因比较复杂，可能与以下因素有关。
1.汗疱疹：这是一种对称发生在手掌、脚底或手指、脚趾侧面的水疱性皮肤病。病因尚不清楚，可能与局部过敏、皮肤癣菌感染、精神因素、系统性疾病、遗传等有关。患者会出现深在性小水疱，米粒大小，略高出皮肤表面，无炎症反应，分散或成群分布。水疱干涸后会出现蜕皮，一般没有明显的自觉症状，或伴有不同程度的瘙痒、烧灼感。汗疱疹通常在春末夏初开始发病，夏季加重，冬季可自愈。
2.手癣：由真菌感染引起，具有传染性。主要通过直接接触患者或患病动物而感染，也可由自身感染（先患有足癣、股癣等）而发生。手癣的临床表现为水疱、鳞屑、角化、皲裂等，可单发或多发于手掌、手指侧面、指间等部位。水疱壁厚，内容物澄清，水疱干涸后会出现脱屑，常伴有瘙痒。手癣的病程较长，容易反复发作。
3.湿疹：一种由多种内外因素引起的皮肤炎症反应。病因复杂，可能与过敏、感染、内分泌失调、精神因素、遗传等有关。湿疹的临床表现多样，可表现为红斑、丘疹、水疱、渗出、结痂、脱屑、苔藓样变等，可局限于某一部位，也可泛发全身。湿疹的病程较长，容易反复发作，伴有明显的瘙痒。
4.接触性皮炎：皮肤或黏膜接触某些外界物质后，在接触部位发生的炎症反应。病因明确，是由于接触了过敏原或刺激物引起的。接触性皮炎的临床表现为红斑、丘疹、水疱、渗出、结痂、脱屑等，可单发或多发于接触部位。水疱壁厚，内容物澄清，水疱干涸后会出现脱屑，伴有明显的瘙痒或烧灼感。接触性皮炎的病程较短，去除病因后，皮损可在短期内消退。
5.其他：手指上起小水泡还可能与其他疾病有关，如掌跖脓疱病、剥脱性角质松解症、手足口病等。
如果手指上起小水泡伴有明显的瘙痒、疼痛、烧灼感等不适症状，建议及时就医，明确诊断，并在医生的指导下进行治疗。同时，要注意保持手指的清洁、干燥，避免搔抓、摩擦，避免接触过敏原或刺激物。