痛经的原因较为复杂，主要与前列腺素分泌增加、精神神经因素、子宫颈管狭窄、子宫位置异常、遗传因素、内分泌因素、子宫内膜以及月经血中前列腺素含量升高、子宫的过度收缩、子宫不正常收缩、妇科病、少女初潮及其他因素有关。此外，原发性痛经可能与经期子宫内膜释放前列腺素增加、子宫内膜前列腺素含量升高等有关，而继发性痛经多由子宫内膜异位症、子宫腺肌病、盆腔炎性疾病等引起。
月经期间肚子疼（痛经）的原因主要有以下几点：
1.（一）前列腺素分泌增加：（1）前列腺素含量升高，（2）尤其是PGF2α含量升高，（3）可引起子宫平滑肌过强收缩，血管挛缩，造成子宫缺血、乏氧状态而出现痛经。
2.（二）精神、神经因素：（1）部分患者对疼痛过分敏感。（2）精神紧张、焦虑或情绪不稳定，均可通过中枢神经系统刺激盆腔，引起疼痛。（3）精神因素在原发性痛经中起主要作用。
3.（三）子宫颈管狭窄：（1）主要是月经外流受阻，（2）引起痛经。
4.（四）子宫位置异常：（1）若妇女子宫位置极度后屈或前屈，（2）可影响经血通畅而致痛经。
5.（五）遗传因素：（1）女儿发生痛经与母亲痛经有一定的关系。（2）女儿痛经的原因可能与母亲的痛经有关。
6.（六）内分泌因素：（1）月经时子宫内膜前列腺素（PG）含量增高，PGF2α含量增高是造成痛经的主要原因。（2）PGF2α含量高可引起子宫平滑肌过强收缩，血管痉挛，造成子宫缺血、乏氧状态而出现痛经。
7.（七）子宫内膜以及月经血中前列腺素（PG）含量升高：（1）PGF2α含量升高时，（2）会引起子宫平滑肌过强收缩，血管痉挛，（3）造成子宫缺血、乏氧状态而出现痛经。
8.（八）子宫的过度收缩：（1）虽然痛经患者子宫收缩压力与正常妇女基本相同（正常者压力约为4.9Kpa），（2）但子宫收缩持续时间较长，且往往不易完全放松，（3）故发生因子宫过度收缩所致的痛经。
9.（九）子宫不正常收缩：（1）痛经患者常有子宫不正常收缩，（2）因此往往导致子宫平滑肌缺血，（3）子宫肌肉的缺血又可引起子宫肌肉的痉挛性收缩，从而产生疼痛而出现痛经。
10.（十）妇科病：（1）如子宫内膜异位症、盆腔炎、子宫腺肌症、子宫肌瘤等。（2）子宫内放置节育器（俗称节育环）也易引起痛经。
11.（十一）少女初潮：（1）心理压力大、久坐导致气血循环变差、经血运行不畅、爱吃冷饮食品等造成痛经。（2）经期剧烈运动、受风寒湿冷侵袭等，均易引发痛经。
12.（十二）其他：（1）原发性痛经可能与经期子宫内膜释放前列腺素增加、子宫内膜前列腺素含量升高、子宫收缩异常、子宫血流量改变以及精神、神经因素等有关。（2）继发性痛经多由子宫内膜异位症、子宫腺肌病、盆腔炎性疾病、子宫肌瘤、子宫畸形、宫腔粘连等引起。