小孩细菌感染引起发烧39度，需要及时就医，在医生的指导下进行治疗。以下是一些处理建议：
1.服用退烧药：如果小孩的体温超过38.5℃，可以在医生的指导下服用退烧药，如布洛芬或对乙酰氨基酚等。服用退烧药可以缓解小孩的发热症状，减轻不适。
2.物理降温：除了服用退烧药外，还可以采用物理降温的方法，如使用温水擦拭身体、使用退热贴等。这些方法可以帮助小孩降低体温，但需要注意保持室内温度适宜，避免小孩着凉。
3.多喝水：发烧会导致小孩体内水分流失，因此需要多喝水，以补充水分和维持身体水分平衡。可以给小孩喝适量的温开水、果汁或口服补液盐等。
4.注意休息：小孩在发烧期间需要多休息，以帮助身体恢复。可以让小孩躺在床上，保持室内安静，避免过度活动。
5.观察病情：需要密切观察小孩的病情变化，包括体温、精神状态、呼吸等。如果小孩的体温持续不降、精神状态变差、呼吸急促等，应及时就医。
6.就医治疗：细菌感染引起的发烧通常需要使用抗生素进行治疗。医生会根据小孩的具体情况开具合适的药物，并告知用药方法和注意事项。
7.注意个人卫生：在小孩生病期间，要注意保持个人卫生，勤洗手，避免交叉感染。同时，要保持室内空气流通，定期消毒。
需要注意的是，每个小孩的病情和身体状况都不同，因此在处理小孩细菌感染引起的发烧时，最好遵循医生的建议。如果对小孩的病情有任何疑问或担忧，应及时与医生沟通。