甲硝唑栓的禁忌包括对硝基咪唑类药物过敏者、孕妇及哺乳期妇女、有活动性中枢神经疾病和血液病者禁用。孕妇及哺乳期妇女禁用的原因分别为甲硝唑栓可透过胎盘且在乳汁中浓度与血中相似，可能对胎儿和幼儿产生不良影响；甲硝唑栓可能引起周围神经炎和惊厥，还会减少血液中还原型谷胱甘肽，延长凝血酶原时间。
甲硝唑栓的禁忌主要包括以下几点：
一、对硝基咪唑类药物过敏者禁用。
二、孕妇及哺乳期妇女禁用。
1.甲硝唑栓可透过胎盘，迅速进入胎儿循环。动物实验发现腹腔给药对胎仔具毒性，而口服给药无毒性。本品对胎儿的影响尚无足够和严密的对照观察，因此孕妇禁用。
2.甲硝唑栓在乳汁中浓度与血中相似。动物试验显示甲硝唑对幼鼠具致癌作用，因此哺乳期妇女禁用。
三、有活动性中枢神经疾病和血液病者禁用。
(1)甲硝唑栓可引起周围神经炎和惊厥，因此有活动性中枢神经疾病患者禁用。
(2)本品中的硝基还原成氨基，会使血液中还原型谷胱甘肽减少，导致凝血酶原时间延长，因此有血液病者禁用。