莫匹罗星软膏的使用注意事项包括：症状未缓解或加重须就医；广泛感染者应医院诊治；仅适用于皮肤，不可用于眼、鼻、口等黏膜部位，误入眼内要及时清水冲洗；中、重度肾损害患者慎用；对该软膏过敏者应避免使用，过敏性体质者慎用；药物应放置在儿童够不到的地方，儿童使用时须大人监督。需注意对莫匹罗星软膏过敏者不能服用阿莫西林胶囊。
莫匹罗星软膏可能产生的副作用及注意事项如下：
1.若使用后症状未缓解或加重，需立即就医。
2.广泛感染者应前往医院诊治。
3.该软膏仅适用于皮肤，不可用于眼睛、鼻和口等黏膜部位。
4.若不慎误入眼内，应及时用清水冲洗。
5.中、重度肾损害患者需谨慎使用。
6.对莫匹罗星软膏过敏者，应在医师指导下服用阿莫西林胶囊，但需注意，此处表述可能存在错误，对莫匹罗星软膏过敏者应避免使用该药物，而不是服用阿莫西林胶囊。另外，有过敏性体质者应慎用。
7.应将莫匹罗星软膏放置在儿童够不到的地方。
8.儿童使用该药物时必须在大人的监督下进行。