宝宝出生时缺氧是否有后遗症取决于缺氧程度，阿普加评分可判断缺氧情况，轻度窒息经处理多可恢复，重度窒息即便存活也可能因大脑细胞受损出现后遗症，且缺氧宝宝抵抗力下降，还易出现吸入性肺炎、新生儿硬肿症、低血钙、低血糖、新生儿颅内出血、周身感染等多种疾病，所以宝宝出生时缺氧的后果不容忽视，需密切关注并及时治疗护理。
宝宝出生时缺氧是否会有后遗症，取决于缺氧的程度。
一般来说，根据一分钟阿普加评分结果进行判断。各项总分810分为无窒息，这类宝宝通常不会有后遗症。47分为轻度窒息，七分以上为轻度缺氧，一般不影响预后，经过积极处理，宝宝常可在短时间内恢复正常。46分为中度窒息，经积极处理，也有较大可能在短时间内恢复。而03分属重度窒息，少于四分为重度缺氧窒息，伴有呼吸抑制的表现。这类宝宝即便经急救复苏后幸运存活下来，由于长时间缺氧导致大脑细胞受损，日后可能会出现智力低下、运动障碍等后遗症。
此外，患病的宝宝抵抗力下降，还容易出现多种疾病。比如吸入性肺炎，这是因为宝宝缺氧后呼吸功能可能受到影响，容易导致吸入异物引发肺炎。新生儿硬肿症也可能发生，缺氧会影响宝宝的体温调节功能，增加硬肿症的发病风险。低血钙、低血糖也可能出现，缺氧会干扰宝宝的新陈代谢，影响钙和血糖的平衡。新生儿颅内出血的风险也会增加，缺氧会对脑血管造成损伤，从而引发颅内出血。还有周身感染，宝宝缺氧后免疫力降低，容易受到病原体的侵袭，导致感染的发生。
总之，宝宝出生时缺氧可能带来的后果不容忽视，需要密切关注宝宝的状况，并根据具体情况进行及时有效的治疗和护理。