吞口水耳朵疼可能是耳部疾病、咽喉部疾病或其他原因引起，如中耳炎、外耳道炎、外耳道疖、急性咽炎、扁桃体炎、颞下颌关节紊乱综合征、茎突过长综合征、神经痛等。具体原因需就医检查后确定，以便进行针对性治疗。
吞口水耳朵疼的原因可能有以下几种：
1.耳部疾病：（1）中耳炎：中耳腔通过咽鼓管与鼻咽部相通。当发生中耳炎时，炎症可通过咽鼓管波及耳部，引起耳部疼痛。（2）外耳道炎：外耳道皮肤损伤或感染时，吞咽口水时可刺激外耳道，引起耳部疼痛。（3）外耳道疖：外耳道软骨部皮肤毛囊或皮脂腺被葡萄球菌感染，形成局限性化脓性炎症，称为外耳道疖。在张口、咀嚼或吞咽时，疼痛可加重。
2.咽喉部疾病：（1）急性咽炎：咽黏膜、黏膜下组织及其淋巴组织的急性炎症，可波及耳部，引起耳部疼痛。（2）扁桃体炎：扁桃体的炎症可向周围组织扩散，引起耳部放射性疼痛。
3.其他原因：（1）颞下颌关节紊乱综合征：可导致咀嚼肌疼痛，进而引起耳部疼痛。（2）茎突过长综合征：茎突过长可刺激咽部引起疼痛，吞咽时疼痛加重，疼痛可放射至耳部。（3）神经痛：如舌咽神经痛，疼痛可放射至耳部。
如果出现吞口水耳朵疼的症状，建议及时就医，明确病因，以便进行针对性治疗。