男生腋下长疙瘩并伴有疼痛的原因有很多，可能是感染性因素，如皮肤疖肿、汗腺炎、淋巴结炎、皮脂腺囊肿感染等；也可能是非感染性因素，如皮肤肿瘤、汗腺肿瘤等；此外，外伤、药物过敏、自身免疫性疾病等也可能导致这种情况。如果疙瘩持续不消失或逐渐增大，或伴有其他症状，应及时就医，明确诊断后进行治疗。同时，要注意保持腋下清洁，避免搔抓和刺激。
男生腋下长疙瘩并伴有疼痛，可能由以下原因引起。
一、感染性因素
1.皮肤疖肿
皮肤受到细菌感染后，可引发疖肿，从而导致腋下出现红疙瘩，并伴有疼痛。
2.汗腺炎
腋窝部位的汗腺发生感染，可引起汗腺炎，出现以毛囊为中心的红色丘疹，伴有疼痛。
3.淋巴结炎
腋下淋巴结受到细菌或病毒感染，可发生炎症，导致淋巴结肿大、疼痛。
4.皮脂腺囊肿感染
皮脂腺排泄管阻塞，皮脂腺囊状上皮被逐渐增多的内容物膨胀，形成潴留性囊肿。若发生感染，可出现红肿、疼痛。
二、非感染性因素
1.皮肤肿瘤
如皮脂腺囊肿、脂肪瘤等，当发生感染或恶变时，可出现疼痛。
2.汗腺肿瘤
腋窝部位的汗腺也可能发生肿瘤，如汗腺癌等，可导致腋下出现肿物，并伴有疼痛。
3.其他
恶性淋巴瘤、白血病等血液系统疾病，以及乳腺癌等其他部位的肿瘤转移至腋窝淋巴结，也可引起腋下疙瘩和疼痛。
三、其他原因
1.外伤
腋下受到外伤，如挫伤、刺伤等，可导致局部淤血、肿胀，引起疼痛。
2.药物过敏
某些药物可能引起过敏反应，导致皮肤出现红疙瘩和疼痛。
3.自身免疫性疾病
如系统性红斑狼疮等自身免疫性疾病，可累及全身多个系统和器官，包括皮肤和淋巴结，导致腋下疙瘩和疼痛。
总之，男生腋下长疙瘩并伴有疼痛的原因较多，可能是感染性疾病，也可能是非感染性疾病或其他原因。如果疙瘩持续不消失或逐渐增大，或伴有其他症状，如发热、乏力等，应及时就医，进行相关检查，如血常规、超声、病理检查等，以明确诊断，并采取相应的治疗措施。同时，要注意保持腋下清洁，避免搔抓和刺激，避免食用辛辣刺激性食物。