怀孕两周时同房是否有影响，需要根据具体情况来判断，可能有以下几种情况：
1.一般情况下，怀孕两周时孕囊较小，同房可能不会对胎儿产生明显影响。但需要注意动作轻柔，避免剧烈运动和刺激。
2.如果在同房过程中出现腹痛、阴道流血等异常情况，可能是先兆流产的迹象，需要及时就医。医生会进行详细的检查，如超声检查、孕激素水平测定等，以评估胎儿的情况，并采取相应的保胎措施。
3.极少数情况下，同房可能会导致感染，如阴道炎、宫颈炎等。如果感染得不到及时治疗，可能会影响胎儿的发育。
4.此外，在怀孕早期，孕妇的身体和心理状态都比较敏感，同房时需要注意孕妇的感受，避免过度疲劳和精神紧张。
需要注意的是，每个孕妇的身体状况和孕期情况都不同，因此最好在同房前咨询医生的意见。医生会根据具体情况进行评估，并提供个性化的建议。同时，孕妇在孕期应注意保持良好的生活习惯，如均衡饮食、适量运动、避免吸烟和饮酒等，以保障自身和胎儿的健康。