怀孕两周时不知道的情况下进行了同房，可能会对胎儿产生一定的影响，但也不必过于紧张，可根据自身情况采取以下措施。
1.观察身体状况：如果没有出现腹痛、阴道流血等不适症状，一般不需要特殊处理，可先观察身体状况。同时，要注意休息，避免过度劳累和剧烈运动。
2.注意个人卫生：同房后要注意保持外阴清洁，勤换内裤，预防感染。
3.补充叶酸：怀孕前3个月需要补充叶酸，以预防神经管畸形。同房后可以继续补充叶酸，同时要注意饮食均衡，多吃富含叶酸的食物，如绿叶蔬菜、豆类、动物肝脏等。
4.按时产检：怀孕后要按时产检，以便及时发现和处理问题。在产检过程中，医生会根据孕周和胎儿的发育情况，安排相应的检查项目，如B超、唐氏筛查、四维彩超等。
5.避免再次同房：怀孕早期，胎盘尚未形成，孕囊与子宫壁的连接不紧密，此时同房容易导致流产。因此，在怀孕的前3个月，应避免再次同房。
需要注意的是，每个人的身体状况和胎儿的发育情况都不同，如果在同房后出现了不适症状，应及时就医，并告知医生同房的时间和情况，以便医生进行准确的诊断和治疗。同时，在怀孕期间，应保持良好的心态，避免过度紧张和焦虑，这对胎儿的发育也非常重要。