莫沙必利的主要成分是枸橼酸莫沙必利，是选择性5 - 羟色胺4（5 - HT4）受体激动剂，副作用及不良反应相对较少，应用更广泛；吗丁啉的主要成分是多潘立酮，是外周性多巴胺受体拮抗剂，二者都可促胃肠动力、缓解相关症状，使用时可完善检查明确病因，它们在药物成分、作用机理、副作用及临床应用方面存在区别。
莫沙必利和吗丁啉在药物成分、作用机理、副作用及临床应用方面存在区别。
一、药物成分
莫沙必利的主要成分是枸橼酸莫沙必利，而吗丁啉的主要成分是多潘立酮。
二、作用机理
1.莫沙必利是一种选择性5羟色胺4（5HT4）受体激动剂，通过兴奋胃肠道胆碱能中间神经元及肌间神经丛的5HT4受体，促进乙酰胆碱的释放，从而增强胃肠道运动，改善功能性消化不良患者的胃肠道症状。
2.吗丁啉是外周性多巴胺受体拮抗剂，直接作用于胃肠壁，可增加食道下部括约肌张力，防止胃食道反流，增强胃蠕动，促进胃排空，协调胃与十二指肠运动，抑制恶心、呕吐，并能有效地防止胆汁反流，不影响胃液分泌。
三、副作用及不良反应
相对于吗丁啉，莫沙必利的副作用以及不良反应相对较少。
四、临床应用
莫沙必利和吗丁啉都可用于促胃肠动力，帮助缓解腹胀、消化不良等症状。但在临床上，由于莫沙必利的副作用相对较少，应用更为广泛。同时，在使用这两种药物时，可完善胃镜等检查，明确是否有胃以及十二指肠等方面的器质性疾病，以便针对病因进行治疗。