《新生儿疾病筛查管理办法》规定的筛查病种包括先天性甲状腺功能减低症、苯丙酮尿症等遗传代谢病和听力障碍，各地还在陆续增加新的病种。其主要筛查方法有滤纸干血片采集、串联质谱技术和听力筛查。
根据《新生儿疾病筛查管理办法》规定，新生儿疾病筛查病种包括：先天性甲状腺功能减低症、苯丙酮尿症等遗传代谢病和听力障碍。目前，各地按照国家卫生健康委有关工作要求，还在陆续增加新的筛查病种。
筛查方法主要有以下几种：
1.滤纸干血片采集：通过采集新生儿足跟部的血液，制成滤纸干血片，用于检测苯丙酮尿症和先天性甲状腺功能减低症等遗传代谢病。
2.串联质谱技术：通过检测新生儿滤纸干血片中的氨基酸和酰基肉碱，对多种遗传代谢病进行筛查。
3.听力筛查：通过耳声发射、自动听性脑干反应等技术，对新生儿进行听力筛查。
需要注意的是，新生儿疾病筛查是一项非常重要的工作，家长应该积极配合医院或相关机构的工作人员，按照要求及时采集血样或进行听力筛查。同时，如果发现新生儿有异常情况，应及时就医进行进一步检查和诊断。