生殖器疱疹的症状与原发或复发有关，原发性生殖器疱疹在首次感染后部分人无症状，有症状者男性在阴茎等部位出现红疙瘩、水疱、糜烂或溃疡等，女性全身和局部症状更重，有外阴阴道炎等表现；复发性生殖器疱疹在免疫力低下时再次发作，症状较轻，生殖器部位出现水疱、溃疡，一般7 - 10天左右痊愈。
生殖器疱疹的症状与原发或复发有关。
原发性生殖器疱疹是首次感染疱疹病毒后出现的症状。部分人首次感染后无任何表现，病毒潜伏在体内。有症状的人群中，男性可在阴茎、冠状沟、尿道口或阴囊等部位出现小红疙瘩，可能伴有轻微痒感，很快变为小水疱。35天后水疱可发生糜烂或形成溃疡，可有明显或轻微疼痛。溃疡大小和形状因人而异，与个人免疫力有关。溃疡持续12周后结痂，形成新表皮。
女性全身和局部症状相较男性更重，一般表现为外阴阴道炎或外阴炎，部分病人发生在宫颈，出现宫颈糜烂和小水疱。常见症状有阴道分泌物增多、排尿困难或尿潴留，部分患者有局部淋巴结肿大、疼痛，可能还会发烧。
复发性生殖器疱疹是以前感染且发作过，在免疫力低下时再次发作。此时症状往往较轻，局部可有痒感、烧灼感或刺痛感。皮损局限在生殖器部位，常在一侧，红斑基础上出现水疱，少则23个，多则10几个，局部有轻度疼痛和烧灼感。水疱破裂形成溃疡时疼痛较明显，一般710天左右痊愈。