患者左侧肚子和左侧腰痛可能由盆腔炎和腰椎间盘突出共同引起，此前妇科治疗后疼痛缓解后又复发，胃肠镜检查显示有胆汁反流、息肉及幽门螺旋杆菌感染（正在治疗），建议继续治疗盆腔炎，对腰椎间盘突出进行相应治疗和康复训练，完成幽门螺旋杆菌治疗疗程后复查，具体诊断和治疗方案应根据进一步检查和医生建议调整。
从患者的描述来看，其左侧肚子和左侧腰痛的问题可能是由多种原因引起的。以下是对这些问题的详细分析：
1.妇科问题：患者之前的妇科检查显示有盆腔积液，且经过妇科治疗后疼痛有所缓解，之后又复发。此外，患者自己感觉肚子不舒服与腰痛有密切关系，输液使用消炎药后症状有所改善，这些都提示盆腔炎可能是导致左侧肚子和腰痛的原因之一。
2.胃肠问题：患者曾因胃肠功能紊乱就诊，进行了胃肠镜检查，结果显示肠道没有问题，但有胆汁反流、息肉（暂未处理）和幽门螺旋杆菌感染。目前正在接受幽门螺旋杆菌的治疗。虽然胃肠问题可能会引起腹部不适，但从目前的检查结果来看，似乎并不是导致左侧肚子和腰痛的主要原因。
3.腰椎间盘突出：患者检查出有一点腰椎间盘突出，这也可能是导致腰痛的原因之一，但一般腰椎间盘突出引起的疼痛多为放射性疼痛，可从腰部向臀部、大腿后侧、小腿外侧直至足部放射，与患者描述的左侧肚子先痛，然后引起腰痛的情况不完全相符。
综上所述，患者的左侧肚子和左侧腰痛可能是由盆腔炎和腰椎间盘突出共同引起的。在治疗方面，建议继续针对盆腔炎进行治疗，同时对腰椎间盘突出进行相应的治疗和康复训练。对于幽门螺旋杆菌的治疗，应按照医生的建议完成疗程，停药一个月后进行复查。在治疗过程中，如出现其他问题或症状加重，应及时就医。
需要注意的是，以上分析仅基于患者提供的信息，具体诊断和治疗方案应根据进一步的检查和医生的建议进行调整。