双侧基底节区腔隙性脑梗死的治疗方法包括药物治疗（抗血小板聚集、调脂稳定斑块）、急性期治疗（静脉输注活血化瘀及改善脑代谢的药物）、基础疾病治疗（控制血压血糖）、饮食调整（低盐低脂、多喝水）、运动康复（病情稳定后适当运动）以及长期用药（如阿司匹林、氯吡格雷等）和复查（血常规、肝肾功、血脂等）。
双侧基底节区腔隙性脑梗死的治疗方法如下：
1.药物治疗
抗血小板聚集治疗：可选用阿司匹林、氯吡格雷等药物，以减少血栓形成的风险。
调脂稳定斑块治疗：口服阿托伐他汀钙或瑞舒伐他汀钙等药物，有助于调节血脂，稳定斑块。
2.急性期治疗
静脉输注液体：在急性期脑梗死时，可采用静脉输注活血化瘀的药物，如疏血通、舒血宁等，以及改善脑代谢的药物，如胞磷胆碱钠、丁苯酞等。
3.基础疾病治疗
控制血压：对于血压高的患者，应积极控制血压，使其维持在正常范围内。
控制血糖：糖尿病患者要严格控制血糖，以减少并发症的发生。
4.饮食调整
低盐低脂饮食：减少盐分和脂肪的摄入，避免加重血管负担。
多喝水：有助于保持血液流动性。
5.运动康复
病情稳定后，应适当进行运动，促进身体恢复，但要注意运动强度和方式。
6.长期用药及复查
在没有出血的情况下，阿司匹林、氯吡格雷等药物建议长期口服。
定期门诊复查血常规、肝肾功、血脂等，以便及时调整治疗方案。