新生儿先天性肾上腺皮质增生症的确诊需要结合临床症状、实验室检查和其他检查。临床症状包括女婴外生殖器男性化、男婴阴茎较大等。实验室检查主要有血17羟孕酮、血皮质醇、促肾上腺皮质激素、尿17酮类固醇和17羟皮质类固醇测定等，基因检测也有助于确诊。此外，还需与假性先天性肾上腺皮质增生症及其他遗传代谢病等进行鉴别。
先天性肾上腺皮质增生症是一种常染色体隐性遗传病，由于肾上腺皮质激素合成过程中所需酶的先天性缺陷所致。以下是关于如何确诊新生儿患有先天性肾上腺皮质增生症的具体分析：
一、临床症状
1.女婴：外生殖器男性化，阴唇阴囊融合，阴蒂肥大似阴茎。
2.男婴：阴茎较大，睾丸发育差，阴囊色素沉着。
3.失盐型：生后数天出现拒食、呕吐、腹泻、体重不增、脱水、电解质紊乱、代谢性酸中毒。
二、实验室检查
1.血17羟孕酮（17OHP）：>15ng/ml（化学发光免疫分析法），或>2ng/ml（酶联免疫吸附法）。
2.血皮质醇：降低。
3.促肾上腺皮质激素（ACTH）：升高。
4.尿17酮类固醇（17KS）和17羟皮质类固醇（17OHCS）：排出量增加。
5.基因检测：可检测到相关基因突变。
三、其他检查
1.B超：双侧肾上腺增大或有结节。
2.地塞米松抑制试验：用于鉴别单纯性男性化和先天性肾上腺皮质增生症。
3.盐皮质激素受体拮抗剂试验：用于确诊先天性肾上腺皮质增生症。
四、诊断标准
1.具备上述临床症状或体征。
2.血17OHP升高，伴或不伴血皮质醇降低。
3.其他检查支持诊断。
五、鉴别诊断
1.假性先天性肾上腺皮质增生症：常染色体显性遗传，无明显高雄激素血症，仅血17OHP轻度升高。
2.其他疾病：如先天性肾上腺发育不良、其他遗传代谢病等。
综上所述，对于有先天性肾上腺皮质增生症高危因素的新生儿，应及时进行相关检查，包括血17OHP、血皮质醇、ACTH、尿17KS和17OHCS测定等，以明确诊断。基因检测有助于确诊和分型。同时，需与其他疾病进行鉴别诊断。确诊后应及时治疗，以避免出现严重并发症。