一、胚胎因素
染色体异常是导致胎停的重要胚胎自身原因，约占50%~60%。无论是染色体数目异常（如三体、单体等）还是结构异常（如缺失、易位等），均可能干扰胚胎正常发育进程，致使胚胎无法继续生长而停止发育。
二、母体因素
（一）全身性疾病
孕妇患有严重感染（如败血症等）、高热疾病可影响胎盘血液循环；严重贫血或心力衰竭会导致胎儿氧供不足；慢性肝肾疾病或高血压可使胎盘功能受损，这些情况均可能引发胎停。
（二）内分泌异常
1.黄体功能不全：黄体分泌的孕酮等激素对维持妊娠至关重要，黄体功能不全时孕酮分泌不足，无法为胚胎着床及发育提供良好的内分泌环境，易导致胎停。
2.甲状腺功能减退：甲状腺激素参与胚胎发育的多个关键环节，甲状腺功能减退时甲状腺激素水平低下，会影响胚胎的生长发育，增加胎停风险。
3.糖尿病血糖控制不良：高血糖环境会干扰胚胎的代谢过程，影响胚胎正常发育，进而可能引发胎停。
三、免疫功能异常
（一）自身免疫性疾病
如系统性红斑狼疮等自身免疫性疾病，机体免疫系统会错误攻击胚胎组织，破坏胚胎着床及发育的免疫耐受环境，导致胎停。
（二）同种免疫异常
孕妇与胎儿之间的免疫识别异常，母体对胚胎产生免疫排斥反应，干扰胚胎种植及发育，从而引发胎停。
四、子宫解剖异常
（一）子宫畸形
像单角子宫、双角子宫等子宫畸形，子宫形态异常会影响胚胎着床后的空间及血供，不利于胚胎正常生长，增加胎停几率。
（二）宫腔粘连
宫腔粘连会使宫腔容积减小，内膜损伤影响胚胎着床及营养供应，易导致胎停。
（三）子宫肌瘤
较大的子宫肌瘤可能压迫宫腔或影响子宫血供，干扰胚胎发育，引发胎停。
五、不良生活方式
过量吸烟、酗酒以及接触毒品等有害物质，其中的有害成分会通过胎盘影响胚胎，破坏胚胎正常发育的内环境，增加胎停发生的可能性。
六、父亲因素
精子染色体异常也可能传递给胚胎，导致胚胎发育异常，进而引发胎停。