一、先天性因素
胚胎发育期间，黑色素细胞从神经嵴向表皮移行过程中出现局部聚集，可导致嘴唇上形成黑痣，此类黑痣多从出生时即存在，与遗传等胚胎发育相关因素有关，不同性别在胚胎发育阶段受影响差异不大，但个体遗传背景不同可能使先天性黑痣发生概率有所不同。
二、后天性因素
1.紫外线照射：长期暴露于阳光下，紫外线会刺激皮肤中的黑色素细胞产生更多黑色素，嘴唇部位皮肤较薄，长期受紫外线照射易促使黑痣形成，成年人尤其是户外活动频繁者，因紫外线接触机会多，相对更易因紫外线导致嘴唇出现黑痣。
2.激素水平变化：女性在青春期、孕期等激素水平波动较大时期，体内激素变化可影响黑色素细胞的功能与分布，进而导致嘴唇出现黑痣，女性在这些特殊生理阶段需留意激素变化对皮肤的影响。
3.外伤：嘴唇部位若发生擦伤、磕碰等外伤，修复过程中可能刺激黑色素细胞异常聚集，从而形成黑痣，儿童活泼好动，嘴唇部位外伤相对常见，应注意避免外伤引发黑痣。