CT 通过 X 线成像有辐射，对人体有损伤，在看骨折、出血及肺部疾病方面有优势；核磁共振利用氢质子在磁场中进动成像，无辐射，在中枢神经系统、腹部、盆腔及软组织系统疾病诊断中优于 CT，且其在中枢神经系统检查中无骨质伪影，但看骨折、出血及肺部疾病不如 CT 。
CT与核磁共振的区别如下：
1.成像原理不同：
CT是通过X线成像，X线有辐射，对人体长时间照射有损伤。
核磁共振是利用氢质子在磁场中进动，吸收能量、释放能量，通过计算机形成清晰的断层解剖图像，与CT图像有区别。
2.对某些部位检查的表现不同：
CT在中枢神经系统检查中会产生很多骨质伪影，而核磁共振不会出现这种情况。
CT在看骨折、出血及肺部疾病方面有优势，是核磁共振所不能比拟的。
核磁共振在中枢神经系统、腹部、盆腔以及软组织系统疾病的诊断中远远优于CT。