女性来月经时肚子疼的原因主要有以下几种：
1.盆腔炎：盆腔存在炎症时，月经期间盆腔充血会使炎症加重，从而引起肚子疼。
2.经血排出不畅：来月经时，若经血流通不畅，难以顺利排出，会对子宫产生刺激，导致肚子疼。
3.子宫内膜异位症：子宫内膜细胞本该生长在子宫腔内，但由于某些原因，这些细胞可能会出现在子宫腔以外的部位。在月经期间，这些异位的子宫内膜也会像正常子宫内膜一样脱落出血，但由于不在子宫腔内，血液无法正常排出，就会引起疼痛。
4.子宫腺肌病：这是一种由于子宫内膜腺体及间质侵入子宫肌层引起的疾病。月经时，子宫肌层内的异位内膜充血、水肿，刺激子宫肌层痉挛性收缩，从而产生疼痛。
5.精神因素：月经期间，女性的情绪容易波动，如紧张、焦虑、压力过大等，这些精神因素可能会导致子宫肌肉收缩，引起肚子疼。
需要注意的是，如果月经期间肚子疼的症状较为严重或持续时间较长，应及时就医，以便明确病因并进行相应的治疗。