早上起来头疼可能由睡眠环境不佳等生理性因素或睡眠呼吸暂停综合征、原发性头痛等疾病因素引起，若经常出现且通过改善睡眠环境无法缓解，应及时就医检查并针对性治疗。
早上起来头疼可能由多种原因引起。
一、生理性因素
1.睡眠环境不佳：在封闭、空气不流通的睡眠环境中，同室睡觉的人较多，会导致室内二氧化碳蓄积。二氧化碳变成人体的麻醉剂，使人睡眠时间延长，醒后易出现头昏昏沉沉、头疼的症状。改善睡眠环境，保持通风，症状通常会好转。
二、疾病因素
1.睡眠呼吸暂停综合征：患者在睡眠中间断出现呼吸暂停，可导致间断的血氧降低，损伤神经细胞，从而出现白天醒来时头疼等症状。
2.原发性头痛：部分原发性头痛患者的头痛与睡眠有关，原因不明。
如果早上起来经常出现头疼症状，且通过改善睡眠环境等方法无法缓解，建议及时就医，进行相关检查，以确定病因并进行针对性治疗。