13岁孩子膝盖疼的原因有很多，常见的原因包括：
1.生长痛：13岁正处于生长发育的高峰期，骨骼生长迅速，而肌肉和韧带的生长相对较慢，导致肌肉和韧带被牵扯，从而引起疼痛。这种疼痛通常发生在夜间，疼痛部位主要在膝盖周围，不影响孩子的正常活动，不需要特殊治疗，可通过按摩、热敷等方式缓解。
2.外伤：如果孩子在活动中不小心摔倒或受到撞击，可能会导致膝盖受伤，引起疼痛、肿胀和淤青。需要及时就医，进行详细的检查和治疗。
3.感染：细菌、病毒或结核菌等感染也可能导致膝盖疼痛，同时还可能伴有发热、乏力等全身症状。需要及时就医，进行抗感染治疗。
4.滑膜炎：滑膜是一层覆盖在关节内的薄膜，当滑膜受到炎症刺激时，就会引起滑膜炎，导致膝盖疼痛、肿胀和活动受限。常见的病因包括感染、创伤、自身免疫性疾病等。需要及时就医，进行抗炎治疗。
5.其他：风湿性关节炎、幼年特发性关节炎、骨肿瘤等疾病也可能导致膝盖疼痛。如果孩子的疼痛持续时间较长、疼痛剧烈、影响活动或伴有其他症状，应及时就医，进行详细的检查和治疗。
需要注意的是，每个孩子的情况都可能不同，如果孩子出现膝盖疼痛，家长应及时带孩子就医，进行详细的检查和诊断，以便制定合适的治疗方案。同时，家长应注意孩子的休息和保暖，避免过度活动和受伤。