脚底起小水泡、瘙痒，可能是以下原因引起：
1.足癣：由真菌感染引起，具有传染性。水疱可分布于足底、趾间，伴有瘙痒。可外用抗真菌药物，如克霉唑乳膏、酮康唑乳膏等，严重者可口服抗真菌药物，如伊曲康唑、特比萘芬等。
2.湿疹：病因尚不明确，可能与过敏、感染、环境等因素有关。常表现为红斑、丘疹、水疱、渗出、结痂、脱屑等，伴有瘙痒。可外用糖皮质激素，如丁酸氢化可的松乳膏、糠酸莫米松乳膏等，也可口服抗组胺药物，如氯雷他定、西替利嗪等。
3.汗疱疹：病因尚不清楚，可能与遗传、过敏、精神紧张等因素有关。常发生于手掌、足底，水疱壁厚，伴有瘙痒或烧灼感。可外用炉甘石洗剂、糖皮质激素乳膏等，严重者可口服糖皮质激素、免疫抑制剂等。
4.其他：接触性皮炎、剥脱性角质松解症等也可引起脚底起小水泡、瘙痒。
如果脚底起小水泡、瘙痒，建议及时就医，明确诊断，在医生的指导下进行治疗。同时，要注意保持脚部清洁干燥，避免搔抓，避免接触刺激性物质。