打黄体酮三个月后屁股肿痛，可能是药物不良反应、感染等原因引起。可以采取以下措施。
1.停止注射黄体酮：如果肿痛是由药物引起，停止注射后通常会逐渐缓解。
2.热敷：用热毛巾、热水袋等热敷肿痛部位，每次15~20分钟，每天数次，可促进血液循环，缓解疼痛。
3.按摩：轻柔地按摩肿痛部位，也有助于缓解疼痛。
4.注意休息：避免长时间坐着或站着，尽量休息，以减轻臀部的压力。
5.保持皮肤清洁：保持注射部位的皮肤清洁，避免感染。
6.观察症状：如果肿痛持续不缓解或加重，或出现发热、寒战等其他不适症状，应及时就医。医生可能会进行以下检查和治疗。
检查：医生会检查注射部位的皮肤、肿块的大小、质地、有无波动感等，可能会建议进行血常规、B超等检查，以明确病因。
治疗：如果是感染引起，可能需要使用抗生素进行治疗；如果肿块较大，可能需要进行切开引流。
在注射黄体酮期间，如果出现任何不适，应及时告知医生，以便调整治疗方案。此外，在注射黄体酮后，应注意观察注射部位的情况，如有异常应及时就医。同时，应注意休息，避免长时间坐着或站着，保持皮肤清洁，避免感染。