打黄体酮三个月后屁股肿痛，可能与药物刺激、感染、局部损伤等有关。可以采取以下措施。
1.停止注射黄体酮：如果肿痛是由药物引起的，停止注射后症状可能会逐渐缓解。
2.热敷：用热毛巾或热水袋热敷肿痛部位，每次15~20分钟，每天数次，可促进血液循环，缓解疼痛。
3.按摩：轻轻按摩肿痛部位，可缓解肌肉紧张，促进恢复。
4.注意休息：避免长时间坐着或站着，减轻臀部的压力。
5.保持皮肤清洁：保持注射部位的皮肤清洁，避免感染。
6.如肿痛持续不缓解或加重，或出现发热、寒战等症状，应及时就医，医生可能会建议使用药物（如非甾体抗炎药）治疗，或进行其他检查（如血常规、超声等）以明确病因，并采取相应的治疗措施。
此外，如果对黄体酮注射有任何疑问或担忧，应及时与医生沟通，以便获得更专业的建议和指导。同时，在注射黄体酮期间，应注意观察身体反应，如有异常应及时告知医生。