滤泡增生性咽喉炎一般癌变概率较低，但也不能完全排除个别情况。
一、良性病变为主
滤泡增生性咽喉炎多是咽喉部长期受到炎症刺激等因素引起的淋巴滤泡增生，属于良性病变范畴，多数情况下不会发生癌变。大量临床观察显示，单纯的滤泡增生性咽喉炎患者，在没有其他高危因素持续作用下，癌变几率非常小。
二、存在高危情况需警惕
若滤泡增生性咽喉炎患者同时伴有长期大量吸烟、酗酒，或者咽喉部长期接触有害化学物质等情况，癌变风险会相对升高。比如长期吸烟的人，烟草中的有害物质会持续刺激咽喉黏膜，可能增加细胞发生异常病变的几率，但这也不是绝对会癌变，只是风险有所提升。
三、个体差异影响
不同个体之间存在差异，有些人自身免疫力较强，对炎症刺激的抵抗能力好，那么滤泡增生性咽喉炎癌变的可能性就更低；而一些免疫力低下、有基础疾病的人群，相对来说癌变风险可能会有不同表现，但总体来说滤泡增生性咽喉炎本身癌变概率不是很高。
四、定期监测很重要
患有滤泡增生性咽喉炎的人群，为了及时发现可能出现的异常情况，应定期到医院进行咽喉部检查，如电子喉镜等检查，以便能早期发现是否有异常病变迹象，做到早发现、早处理，保障身体健康。