滤泡增生性咽喉炎的用药需根据具体病情而定，常用药物有清喉利咽类药物等。
一、局部用药
可以使用含漱液，如复方硼砂含漱液，它能清洁口腔、杀菌消炎，减轻咽喉部的炎症反应，缓解滤泡增生带来的不适，适用于大多数滤泡增生性咽喉炎患者，尤其适合口腔卫生状况不佳的人群。
二、中成药
一些清热解毒、利咽消肿的中成药也可选用，比如金嗓利咽丸，其具有疏肝理气、化痰利咽的功效，能改善咽喉部滤泡增生引起的咽部异物感等症状，对于因情志不舒、痰湿内阻导致的滤泡增生性咽喉炎有一定疗效，一般人群均可使用，但孕妇需谨慎。
三、抗生素类药物
若滤泡增生性咽喉炎是由细菌感染引起，可考虑使用抗生素，如阿莫西林，但使用前需确定无青霉素过敏史，一般用于明确有细菌感染证据的患者，儿童使用时需严格遵循医生指导，因为儿童对药物的耐受和反应与成人不同。
四、含片类药物
像西瓜霜含片，能起到清咽利喉、消肿止痛的作用，可缓解滤泡增生性咽喉炎导致的咽喉疼痛、干燥等症状，各年龄段人群均可使用，但儿童含服时需有人监护，防止误吞。