全身疼可能由多种原因引起，比如感染性疾病、自身免疫性疾病、过度劳累等。
感染性疾病导致全身疼
病毒或细菌感染可能引发全身疼痛，像流感病毒感染后，人体会出现发热、全身肌肉酸痛等症状，这是因为病原体在体内引发免疫反应，释放炎性介质，刺激神经导致疼痛。
自身免疫性疾病引发全身疼
例如类风湿关节炎，患者会出现全身多关节疼痛，同时伴有晨僵等表现，自身免疫系统错误攻击关节组织，造成关节及周围组织炎症，进而引起全身疼痛不适。
过度劳累造成全身疼
长时间高强度体力劳动或运动后，身体会产生大量乳酸堆积，乳酸刺激神经末梢，就会导致全身肌肉酸痛，一般休息后可逐渐缓解。
其他因素致全身疼
内分泌紊乱也可能导致全身疼，如甲状腺功能减退症患者，可能会感觉全身乏力、疼痛，这与甲状腺激素分泌不足，影响身体代谢功能有关。老年人骨质疏松时也常出现全身骨痛，是由于骨量丢失，骨结构破坏，引起骨骼疼痛不适。