全身痛可能由多种原因引起，如感染性疾病、自身免疫性疾病、过度劳累等。
感染性疾病引发
病毒感染如流感病毒感染，可导致全身肌肉酸痛、乏力等全身症状，还常伴有发热、咳嗽等表现；细菌感染严重时也可能引发全身炎症反应，出现全身痛。
自身免疫性疾病导致
像类风湿关节炎，会累及全身多个关节，引起关节疼痛、肿胀，进而可能扩散至全身，导致全身肌肉等部位疼痛；系统性红斑狼疮也可出现全身痛，同时伴有面部红斑、口腔溃疡等症状。
过度劳累所致
长时间进行高强度体力劳动或剧烈运动后，身体会产生大量乳酸，乳酸堆积可引起全身肌肉酸痛，一般休息后可逐渐缓解。
其他因素影响
甲状腺功能减退患者由于代谢减慢，可能出现全身乏力、疼痛等症状；一些心理因素如长期精神紧张、焦虑也可能导致躯体化表现，出现全身痛。