细菌感染发烧通常热度较高，多在38.5℃以上，且可能持续较长时间；病毒感染发烧一般热度相对稍低，多在38℃左右，发热时间相对细菌感染可能稍短，但也存在个体差异。
一、体温特点差异
细菌感染引发的发烧，体温上升较快，往往能达到较高水平，比如有些严重细菌感染可使体温迅速攀升至39℃甚至更高，且体温波动相对较小，持续时间较久。而病毒感染引起的发烧，体温一般不会一下子升得特别高，多在38.5℃以下，体温波动相对更灵活些，发热持续时间相对可能短一些，但也不是绝对的。
二、伴随症状不同
细菌感染发烧时常伴有局部感染症状，像肺部细菌感染会有咳嗽、咳痰且痰液可能呈脓性；泌尿系统细菌感染会有尿频、尿急、尿痛等表现。病毒感染发烧伴随症状多以全身症状为主，比如全身酸痛、乏力等，局部症状相对不那么突出，像普通感冒病毒感染多有流涕、鼻塞等症状。
三、血液检查指标区别
进行血常规检查时，细菌感染通常会出现白细胞计数升高，中性粒细胞比例增多；而病毒感染时，白细胞计数多正常或偏低，淋巴细胞比例可能会升高。不过这只是大致情况，具体还需结合临床综合判断。
四、治疗用药有别
细菌感染一般需要使用抗生素来抗感染治疗，比如青霉素类、头孢菌素类等抗生素；病毒感染通常以对症支持治疗为主，如使用抗病毒药物需谨慎，一般普通病毒感染多不用特定抗病毒药，主要是缓解发烧等症状，如使用退烧药等。但具体用药要依据病情由医生决定。
对于儿童来说，细菌感染或病毒感染发烧都要密切关注体温变化，及时采取合适的降温措施，如物理降温等，并且要注意观察孩子精神状态等情况，一旦有异常及时就医。对于老年人，身体机能相对较弱，无论是细菌感染还是病毒感染引起的发烧，都要更谨慎对待，及时就诊，避免延误病情。