进行性肌营养不良症目前尚无根治方法。
基因缺陷相关类型
由基因缺陷导致的进行性肌营养不良症，因基因层面的异常难以从根本上纠正，现有医疗手段难以完全治愈。
病情进展阶段影响
疾病处于不同进展阶段，治疗效果不同。早期病情相对较轻时，虽无法根治，但可通过一些措施延缓病情发展；随着病情进展到中晚期，肌肉功能严重受损，治疗难度大幅增加，治愈更是困难。
不同类型差异
不同类型的进行性肌营养不良症，预后有别。例如杜氏肌营养不良症，病情进展较快且严重，治愈希望极为渺茫；而一些相对罕见类型的进行性肌营养不良症，病情进展相对缓慢，但也无法彻底治愈。
个体差异因素
患者个体差异也会影响对治疗的反应。不同患者对药物等治疗措施的敏感性不同，即便采取相同的治疗方案，最终的治疗效果也大不相同，总体而言都难以达到完全治愈的理想状态。