输卵管宫外孕与卵巢宫外孕均属于异位妊娠，但着床部位不同。输卵管宫外孕是受精卵在输卵管内着床发育，卵巢宫外孕则是受精卵在卵巢组织内着床。
着床部位差异
输卵管宫外孕主要着床于输卵管的不同部位，如输卵管壶腹部、峡部等；而卵巢宫外孕是着床在卵巢实质内。
临床表现区别
输卵管宫外孕常见症状有停经、腹痛、阴道流血等，腹痛多为一侧下腹隐痛或酸胀感；卵巢宫外孕症状与输卵管宫外孕有相似处，但由于着床在卵巢，可能因卵巢组织的特殊性，腹痛表现等会有一定差异，且卵巢宫外孕破裂出血时，可能导致腹腔内出血等严重情况。
诊断方法不同
两者都可通过超声检查等辅助诊断，输卵管宫外孕超声下可在输卵管部位发现妊娠囊等；卵巢宫外孕超声检查可见卵巢内有异常回声等表现，但诊断时需仔细鉴别。
治疗考量不同
对于输卵管宫外孕，治疗方式根据病情等有保守治疗或手术治疗等选择；卵巢宫外孕由于着床部位在卵巢，治疗时也要综合考虑卵巢功能等情况来选择合适的治疗手段，如手术治疗时需尽量保留卵巢功能等。
对于有过盆腔炎症等病史的女性，更易发生异位妊娠，无论是输卵管宫外孕还是卵巢宫外孕，都需及时就医诊断和治疗，以保障女性生殖健康。年轻女性若出现停经、腹痛等异常情况，应尽快就诊排查异位妊娠可能。