跖疣的治疗方法需根据个体情况而定，常见的有效方法包括物理治疗、局部药物治疗等，但不存在绝对最快的方法，需综合评估选择。
一、物理治疗法
激光治疗是常用物理方法，利用激光的高能量直接烧灼疣体，使其碳化坏死。一般单次治疗可去除疣体，但较大或多发跖疣可能需多次治疗。冷冻治疗也是物理手段，通过低温使疣体组织坏死脱落，通常需数周时间起效，部分人可能一次见效。
二、局部药物治疗
5%氟尿嘧啶软膏可用于跖疣治疗，它能抑制细胞DNA、RNA合成，发挥抗增生作用。但使用时需注意避免接触正常皮肤，防止刺激。咪喹莫特乳膏也有一定效果，它能调节局部免疫，刺激机体产生抗病毒细胞因子来对抗疣体。
三、对于免疫功能低下者
免疫功能低下者患跖疣时治疗需更谨慎，可在医生指导下适当辅助提升免疫的方法，同时根据疣体情况选择治疗方式，因为免疫低下可能导致跖疣恢复相对缓慢，要密切关注疣体变化及自身免疫状态调整治疗方案。
四、儿童跖疣治疗
儿童患跖疣时，物理治疗需更加轻柔谨慎，避免对儿童造成过度损伤和心理影响。局部药物治疗要选择刺激性小的药物，且需在成人监护下使用，因为儿童皮肤较为娇嫩，治疗过程中要密切观察皮肤反应，确保治疗安全有效。