甲硝唑泡腾片可能会带来一些副作用，常见的有局部刺激症状，比如用药部位可能出现烧灼感、瘙痒感等；还可能引起胃肠道反应，像恶心、呕吐、食欲不振等；少数人可能出现头痛、眩晕等神经系统症状；另外，也有报道称个别人可能出现皮疹、白细胞减少等过敏或血液系统方面的异常情况。
局部刺激相关副作用
使用甲硝唑泡腾片时，部分患者会在用药局部感受到明显的不适，出现烧灼感较为常见，这是因为药物对阴道局部黏膜产生了一定的刺激作用，使得局部黏膜有异样的感觉。
胃肠道反应相关副作用
一些患者在使用甲硝唑泡腾片后，会出现胃肠道方面的反应，比如恶心，就是患者会有胃部不适、想要呕吐的感觉，这是药物经阴道吸收后可能影响到胃肠道功能导致的。
神经系统相关副作用
少数人使用甲硝唑泡腾片后可能会有头痛的情况，表现为头部出现疼痛不适，还有些人会有眩晕感，感觉自身或周围环境有旋转的异样感觉，这可能是药物对神经系统产生了一定影响。
过敏及血液系统相关副作用
极个别患者可能出现皮疹，皮肤表面出现红色的疹块，伴有瘙痒等不适；还有可能出现白细胞减少等血液系统方面的异常，不过这种情况相对较少见，但一旦出现也需要引起重视。对于特殊人群，比如孕妇及哺乳期妇女，使用甲硝唑泡腾片需要格外谨慎，因为药物可能会通过胎盘或乳汁影响胎儿或婴儿；而儿童一般不建议使用甲硝唑泡腾片，因为儿童的身体器官发育尚未完全，药物副作用对儿童可能产生更严重的影响。