生理性因素
女性在月经期间，子宫内膜前列腺素含量增高，可能引起子宫平滑肌过强收缩、血管痉挛，出现小腹子宫位置隐隐作痛，一般月经结束后可缓解。
妇科疾病
盆腔炎是常见原因，病原体感染盆腔组织引发炎症，可致小腹子宫位置隐痛，常伴阴道分泌物增多、异味等。子宫内膜异位症也会导致，异位的子宫内膜种植在子宫外其他部位，经期时异位内膜出血，刺激周围组织引起疼痛，且疼痛可能进行性加重。
妊娠相关情况
怀孕早期若出现小腹子宫位置隐隐作痛，需警惕先兆流产或宫外孕。宫外孕时，受精卵着床在子宫以外部位，随着胚胎发育，可能导致输卵管等部位破裂出血，引起腹痛。
其他因素
肠道功能紊乱也可能引起小腹子宫位置隐隐作痛，如饮食不规律、进食过多产气食物等导致肠道蠕动异常，可出现类似疼痛。另外，泌尿系统结石，如输尿管结石，也可能放射至小腹子宫位置引起隐痛，常伴排尿异常等表现。
如果出现小腹子宫位置隐隐作痛，持续不缓解或伴有其他异常症状，如阴道异常出血、发热等，应及时就医，进行相关检查，如妇科超声、血常规等，以明确病因，采取相应治疗措施。对于女性来说，平时要注意个人卫生，尤其是经期卫生，保持规律作息和健康饮食，以维护生殖系统健康。