豆浆鸡蛋减肥法并无科学依据支撑其能有效减肥。从营养角度看，单纯依靠这两种食物搭配，无法满足人体每日所需的全面营养，长期如此可能导致营养不良等问题。
营养不均衡问题
豆浆主要提供植物蛋白等，但缺乏某些人体必需的营养成分，鸡蛋虽富含优质蛋白等，但仅靠二者组合，碳水化合物、维生素、矿物质等摄入不足，不能维持身体正常代谢运转来实现健康减肥。
减肥效果难持久
这种单一的饮食模式难以长期坚持，而且人体代谢不会因短期的豆浆鸡蛋搭配就持续高效燃脂，一旦恢复正常饮食，体重很容易反弹。
对特殊人群不适用
对于孕妇、儿童等特殊人群，豆浆鸡蛋减肥法会严重影响他们的营养摄入，孕妇需要充足全面的营养来保障胎儿发育，儿童正处于生长发育关键期，需要均衡营养，该减肥法会对他们的健康造成损害。