一般来说，规范操作下先兆流产做阴超通常不会有明显危害，但若操作不当可能存在一些潜在风险。
操作不当可能引起出血
如果超声探头操作不轻柔，可能刺激宫颈或宫腔，导致阴道少量出血，尤其对于先兆流产本身有少量阴道出血倾向的孕妇，可能会加重出血情况，但这种情况在规范操作下发生概率较低。
可能引发感染风险
虽然概率较小，但如果消毒不严格等操作不规范情况出现，有引发宫腔感染的可能，不过正规医疗机构会严格遵循消毒等操作规范来降低此风险。
对孕妇心理产生影响
部分孕妇可能因担心阴超检查会影响先兆流产状况而产生焦虑情绪，不过这种心理影响更多是心理层面，并非直接的身体危害，但也需关注孕妇心理状态。
特殊人群需特别注意
对于孕早期有先兆流产且宫颈口较松等特殊情况的孕妇，阴超检查需更加谨慎，操作不当可能增加流产风险，这类孕妇更要由经验丰富的医生严格评估后谨慎进行阴超检查。